Игумен Никон (Головко) родился в 1972 г. в Москве.

Окончил Московский Государственный Университет им. М.В. Ломоносова (факультет журналистики), и Коломенскую духовную семинарию (лучшая дипломная работа года).

Работал в Государственном Комитете СССР по телевидению и радиовещанию, затем в Издательском отделе Московского Патриархата.

В 1996 г. пострижен в мантию и рукоположен во иеродиакона. 

В 1997 г. рукоположен в иеромонаха.

С 1997 г. по 2010 г. исполнял послушания настоятеля нескольких приходских храмов Московской областной епархии, наместника Николаевского Пешношского мужского монастыря, члена епархиальных отделов по издательской деятельности и связям со СМИ и по реставрации и строительству, был автором и ведущим православных передач на муниципальном ТВ, редактором православных интернет-сайтов епархии.

В 2010 г. Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом переведен на пастырское служение в Москву.

С 2010 по 2016 г. исполнял послушания секретаря Духовного собора и председателя Издательского совета Донского ставропигиального мужского монастыря г. Москвы, руководителя пресс-службы Синодального комитета по взаимодействию с казачеством и пресс-службы Донского монастыря, был сотрудником телекомпании «Радость моя» и интернет-проекта «Закон Божий».

В апреле 2016 г. направлен в командировку в Русскую духовную миссию в Иерусалиме.

21 октября 2016 г. определением Священного Синода Русской Православной Церкви (журнал № 100) назначен членом Русской духовной миссии в Иерусалиме. С сентября 2018 г. – соискатель степени кандидата богословия в Общецерковной аспирантуре и докторантуре им. святых равноапостольных Кирилла и Мефодия. 

Действительный член Императорского Православного Палестинского Общества и Русского географического общества.